Le directeur de la DDSC peut leur confier des missions de conseil et d'appui, sur demande des autorités d'emploi ou de gestion. Par ailleurs, cette structure peut participer à l'accomplissement des missions exercées par l'inspection générale de l'administration. Des missions d'enquête et de contrôle lui sont confiées en cas d'accidents en opérations.
En son sein, le bureau "prévention accidents-enquêtes" (BPAE) est également chargé de collecter et de rassembler des informations sur la nature des accidents et de mettre en place une doctrine d'emploi pour en limiter leur nombre.